Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DEUP1Q05D60 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms