Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
NUCB1Q02818 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NUCB1Q02818 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms