Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CACNA1DQ01668 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms