Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms