Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRAMEP78395 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms