Protein–RNA interactions for Protein: P78334

GABRE, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABREP78334 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABREP78334 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABREP78334 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GABREP78334 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms