Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ACTA1P68133 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms