Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-21P61565 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms