Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2FP61218 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2FP61218 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms