Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAD23AP54725 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms