Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GCLMP48507 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCLMP48507 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GCLMP48507 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCLMP48507 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCLMP48507 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCLMP48507 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCLMP48507 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GCLMP48507 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GCLMP48507 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GCLMP48507 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GCLMP48507 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms