Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHI3L1P36222 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms