Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2E2P29084 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms