Protein–RNA interactions for Protein: P25103

TACR1, Substance-P receptor, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACR1P25103 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TACR1P25103 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TACR1P25103 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TACR1P25103 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms