Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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