Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms