Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NR2F1P10589 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms