Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IL3P08700 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IL3P08700 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IL3P08700 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IL3P08700 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IL3P08700 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IL3P08700 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IL3P08700 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IL3P08700 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IL3P08700 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IL3P08700 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IL3P08700 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IL3P08700 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IL3P08700 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IL3P08700 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IL3P08700 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IL3P08700 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms