Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ITM2AO43736 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITM2AO43736 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms