Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLGNO14967 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms