Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF839A8K0R7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms