Protein–RNA interactions for Protein: A6NMD2

GOLGA8J, Golgin subfamily A member 8J, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8JA6NMD2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GOLGA8JA6NMD2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GOLGA8JA6NMD2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms