Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms