Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms