Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TRAF6Q9Y4K3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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TRAF6Q9Y4K3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TRAF6Q9Y4K3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAF6Q9Y4K3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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