Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
UBE2J1Q9Y385 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.9□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
UBE2J1Q9Y385 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms