Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC12A4Q9UP95 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms