Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms