Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RIMS3Q9UJD0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms