Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRP68Q9UHB9 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms