Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAPAQ9P0L0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms