Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCMF1Q9P0J7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms