Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC10Q9NYD6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms