Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FANCFQ9NPI8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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