Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LIN28AQ9H9Z2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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