Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FOXQ1Q9C009 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FOXQ1Q9C009 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FOXQ1Q9C009 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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FOXQ1Q9C009 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FOXQ1Q9C009 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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FOXQ1Q9C009 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FOXQ1Q9C009 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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