Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
MAP1LC3CQ9BXW4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms