Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PLVAPQ9BX97 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLVAPQ9BX97 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms