Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BRIP1Q9BX63 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BRIP1Q9BX63 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms