Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NICN1Q9BSH3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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