Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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