Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NXNL1Q96CM4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NXNL1Q96CM4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms