Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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RABGGTAQ92696 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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RABGGTAQ92696 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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RABGGTAQ92696 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RABGGTAQ92696 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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