Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC9A6Q92581 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms