Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLGN4YQ8NFZ3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NLGN4YQ8NFZ3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms