Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q8

COX18, Mitochondrial inner membrane protein COX18, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX18Q8N8Q8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
COX18Q8N8Q8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms