Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SFRP1Q8N474 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SFRP1Q8N474 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms