Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HAPLN4Q86UW8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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