Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC84Q86UT8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms