Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHMP1BQ7LBR1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHMP1BQ7LBR1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms